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基于激光顯微切割-液質聯用技術的微量細胞廣靶脂質組學分析

更新時間:2024-05-27      點擊次數:1283

活細胞無時不在與外界進行著物質和能量的交換,其代謝水平應是其生命體征的主要表現。在健康和疾病中,代謝程序和它們所支持的特定生理功能之間有著密切的聯系。這些核心代謝功能的失調與許多現代疾病有關。由于每個細胞都生活在一個du特的環境中,我們體內沒有一個細胞在新陳代謝、表型和功能上wan全相同。在單細胞分辨率下,解決代謝的時空異質性將推動代謝領域向前發展,并轉換到臨床應用和理解體內系統代謝組學變化的基礎。


相比DNA和RNA,細胞內的代謝物無法擴增,單個細胞能夠提供的用于分析的代謝物濃度低體積小,對分析設備和方法的要求較高。因此,本次研究將具有單細胞取樣精度的激光顯微切割 (LMD, Laser Microdissection)技術和SCIEX 7500高靈敏度質譜系統聯合使用,測試在能夠用于有效分析的細胞數量。



實驗設計


樣品制備:



腦組織做冰凍切片,樣本置于激光顯微切割載物臺;接收端放置PCR管用于分離體的接收。選擇合適的細胞數目或切割面積(如~2000μm2),在調節好相關參數(Power 49、Aperture 5、Speed 13、Bridge size 4)后開始進行切割(圖1)。切割完成后,小心將PCR管取出,由管底倒扣至管蓋蓋緊,防止管蓋中收集的樣品遺落。

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圖1. 腦組織切片樣本用于激光顯微切割分離體制備。在40倍放大視野中選取合適的面積,約2000 μm2(左)進行切割分離并用于后續分析;一份樣品切割分離完成后(右),可繼續選擇其他區域進行操作。




樣品提取:



裝有樣品的PCR管在vortex中振蕩5s,由點甩小型離心機將微量樣品離心至管底,小心打開管蓋,加入30 μL提取溶液(異丙醇:乙腈:水 30:65:5 v/v/v),振蕩混勻,超聲15 min,離心后將全部溶液轉移至進樣小瓶中待LC-MS/MS分析。LC-MS條件:樣品通過ExionLC系統串聯SCIEX 7500系統,進行分析。數據通過SCIEX OS 軟件2.1中的定量功能進行處理。




分析結果



在分離的微量細胞中(組織切片約2000μm2),共檢測到285個脂質化合物,包括鞘脂SM、膽固醇酯CE、甘油三酯TAG、甘油二酯DAG、磷脂酰乙醇胺PE、磷脂酰膽堿PC、神經酰胺Cer7類。

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圖2.微量腦組織切片中測得的不同種類脂質化合物的數量。基于LC-MS/MS 的靶向脂質組學方法快速分析基質中的多種脂類物質。


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圖3.對于微量細胞中檢測到的脂質化合物的判定,主要基于與空白提取溶劑(陰性對照)和血漿脂質提取樣本(陽性對照)共同比較,并且結合各類脂質標準品出峰位置情況、同類脂質化合物有較為接近的出峰位置,而同類脂質化合物連接脂肪酸鏈越長保留時間越靠后、連接相同碳數的脂肪酸鏈上不飽和鍵數越多保留時間越靠前的規律,對微量樣本中檢出的脂質化合物做定性判斷。


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通過徠卡激光切割顯微鏡LMD7獲取微量樣本技術與SCIEX 7500 系統高靈敏度檢測相結合,實現微量細胞高覆蓋靶向脂質組學 PE(P-18:0_18:0)分析檢測。在約2000μm2 組織切片樣品中檢測到脂質化合物數目285個,符合組學分析對化合物覆蓋度的需求。




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