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單獨切除細(xì)胞培養(yǎng)物中的細(xì)胞核，使用已知且未表征蛋白定義的蛋白質(zhì)組學(xué)譜對不同的細(xì)胞狀態(tài)進行分類。在存檔的原發(fā)性黑色素瘤組織中，DVP ^[1] 將空間分辨的蛋白質(zhì)組變化鑒別為正常的黑色素細(xì)胞轉(zhuǎn)化為wanquan侵襲性黑色素瘤，這揭示了隨著腫瘤進展而以空間方式變化的路徑，如轉(zhuǎn)移性垂直生長中的mRNA剪接調(diào)節(jié)異常與干擾素信號和抗原呈遞降低同時進行。DVP在組織背景中保留精密空間蛋白質(zhì)組學(xué)信息的能力對臨床樣本分子表達(dá)譜具有一定的意義。

在本研究中，細(xì)胞或細(xì)胞核使用LMD7激光顯微切割顯微鏡進行切割，該顯微鏡經(jīng)過調(diào)整，適用于自動化的單細(xì)胞自動切割^[1]。

References：

1.Automated Laser Microdissection for Proteome Analysis (Deep Visual Proteomics), Flyer, Leica Microsystems, 2022.

2.Rosenberger FA, Thielert M, Strauss MT, Ammar C, M?dler SC, Schweizer L, Metousis A, Skowronek P, Wahle M, Gote-Schniering J, Semenova A, Schiller HB, Rodriguez E, Nordmann TM, Mund A, Mann M: Spatial single-cell mass spectrometry defines zonation of the hepatocyte proteome, bioRxiv, 3. Dec 2022